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原文轉自奇點網
現在還有什麼CRISPR不能做的嗎?  這是近期《自然》雜誌上刊發的一篇評論裡開頭的一句話,也是我現在的心情。我們知道,CRISPR是一種(超)好用的基因編輯工具,除了給基因序列修修補補、幫助治療疾病,它還能追踪動物的發育過程,快速檢測和診斷疾病,改良農作物,控制蚊子防瘧疾 ……如今,CRISPR又向一個新領域下手了。

智能生物材料!

  

  圖源| pixabay

這種新型的智能材料由水凝膠、單鏈DNA和CRISPR-Cas12a組成。當遇到目標DNA序列,Cas酶就會切斷材料內的DNA,使凝膠的特性發生變化 ——比如說形狀、硬度的變化,又或者是導電性、酸鹼性的變化。

那這個材料能幹的事情就太多了~ 下可做載體靶向腫瘤DNA釋放藥物,上可聯合其他平台做病原體檢測,研究者還開發出了當“保險絲”的用法,可以說只有你想不到沒有做不到~開發出這個大腦洞產品的是MIT的James Collins團隊,論文發表在《科學》上[1]。

  

  甚至可以用來包裝細胞

能夠響應外部環境變化的材料並不罕見,我們上學的時候就應該從物理課本上了解過光敏開關的原理。除了光之外,聲、溫度、電磁場、PH值都是已經廣泛投入使用的可變材料響應元素。

如果把應用限制在生物、醫療領域,那麼很顯然,這些響應元素就不是最優解了。對生物體來說,更敏感更具體的標誌物是啥?大分子啊,蛋白啊,DNA啊!

DNA是科學家們很關注的原材料。DNA本身是高特異性的,能讓材料的變化更有針對性;同時,DNA也能夠作為凝膠的一部分,與各種高聚物交聯生成能夠使用的材料

讓這種DNA交聯材料產生變化,就得通過一些外部方法,比如說DNA置換,比如說酶促反應,總之都是一些很依靠“量”的手段。問題來了,想保證整個兒系統快速敏感,那第一靶向的DNA濃度不能太低,第二換個靶向序列整個兒系統恐怕都得重新設計。

實用性Emmmm……

這個依賴CRISPR的材料智能之處就在這裡了。

這項研究中使用到的是CRISPR-Cas12a。Cas12a和我們最熟悉的Cas9有兩點不同。一,Cas12a對靶向序列的識別方法不一樣,要更精準、錯誤率更低;二,Cas12a在識別、切割所靶向的雙鏈DNA之後,還會隨機切割附近的單鏈DNA

  

  Cas12a還會隨機切割附近的單鏈DNA

用在這個智能材料裡呢,當遇到靶DNA,材料中的Cas12a就會開始工作把單鏈DNA切斷,材料原本的特性就變化啦!

CRISPR可不是個嚴密的定量反應,它能切一個就能切一百個。根據研究者的測算數據,CRISPR-Cas12a系統每秒的工作次數能夠達到1250次。

啥意思呢?只要外面有一丟丟靶DNA激活了CRISPR-Cas12a系統,它就能勤勤懇懇地開始工作了。這就相當於一個信號放大器,很少的DNA就能得到可檢測的材料變化

而且我們知道的,CRISPR識別靶DNA主要靠一條嚮導RNA,更換不同的嚮導RNA,這套智能材料就可以用在任何我們想用的地方

是不是簡單方便好神奇!

在論文中,研究者提出了四種可能的用法。

第一種,做載體

以聚乙二醇(PEG)為基質,遇靶DNA釋放單鏈DNA交聯的物質。

  

  第二種,做包裝

以聚丙烯酰胺(PA)為基質,遇靶DNA整個兒凝膠裂解,釋放內容物。這裡面能包裹的東西就多了,小分子藥物、細胞因子等生物大分子甚至細胞都有可能。

  

  第三種,做電開關

這種材料裡面交聯了導電炭黑(CB),通過切斷單鏈DNA改變材料的導電性。這就是個感應DNA的保險絲啊。

  

  第四種,聯合微流體設備快速檢測病毒

這種材料作為微流體設備種的填充物,隨靶DNA改變滲透性,可以檢測微量的病毒DNA。在實際使用中,和其他基於CRISPR的檢測技術靈敏度基本一樣。

  

  

  能檢測到的病毒量相當低

感覺這個智能材料的應用還遠遠不止這些呢。考慮好生物相容性和定量問題,拿來做生理指標體內監測不覺得也是個好主意嗎?更換不同的Cas酶,識別更多的生物大分子,應用還可以更廣~

果然想像力才是第一科學生產力啊~你有啥腦洞,留言區分享下?

參考資料:

[1]https://science.sciencemag.org/content/365/6455/780/tab-article-info

[2]https://www.nature.com/articles/d41586-019-02542-3

[3]https://science.sciencemag.org/content/365/6455/754